По мере постоянного увеличения интереса к судьбе соотечественников, в т. ч. эстонцев, проживавших в Советской России, расширяются возможности использования архивов, содержащих материалы по данной тематике.
Недавно посредством Saaga (www.ra.ee/dgs), являющегося результатом первого этапа проекта по дигитализации архивов, содержащих документы восточных эстонских диаспор в фондах Государственного архива, открылся доступ примерно к 1500 единицам хранения (почти 190 000 кадров). В них хранится уникальный материал о быте, судьбе и деятельности эстонцев, проживавших в Советской России в 1917–1940 гг.
В 2012 г. в рамках Программы соотечественников были оцифрованы архивные документы первой половины ХХ века в Москве и Санкт-Петербурге. Оцифрованы материалы четырех архивов: архивы эстонских секций Коминтерна в Москве и Ленинграде (ERAF.6495 и ERAF.25) и архивы контрольно-оптационных комиссий в Москве и Петрограде, созданных для оптации эстонцев, проживавших в Советской России, в Эстонию, согласно Тартускому мирному договору 1920 г. (ERA.36 и ERA.28). Личные дела в рамках данного проекта оцифрованы не были.
Архивы эстонских секций Коминтерна представляют уникальный аутентичный материал по эстонцам, проживавшим в СССР в 1920–1930 гг. Многие из тех людей пропали без вести во время сталинских репрессий в конце 1930-х гг. В архиве отражены не только связи и деятельность ЭКП по линии Коминтерна, в нем представлены также документы по истории ЭКП до 1940 г. (в т. ч. период 1917–1920 гг., предшествовавший «независимости» ЭКП). Кроме того, собраны данные об эстонцах СССР и о многом другом.
К архивам контрольно-оптационных комиссий относятся, среди прочего, архивные материалы Эстонского Комитета и Союза эстонских поселенцев, переписка с Эстонскими комитетами на Кавказе, в Армавире и т. д., данные об эстонцах Москвы, списки арестованных в России эстонцев, данные об эстонцах Ямбурга, Пскова, Череповца, Торопца, Одессы и других городов и регионов.